下記の38団体に日本ゲノム微生物学会賛助会員としてご協力頂いております． （2008年10月7日現在 五十音順に掲載）
- 味の素（株）
- アフィメトリクス・ジャパン（株）
- アプライドバイオシステムズジャパン（株）
サイエンスセンタージャパン - アプライドバイオシステムズジャパン（株）
分子生物・細胞生物部 マーケティング - （株）飯田フーズ
- イルミナ（株）
- インシリコバイオロジー（株）
- エムエス機器（株）
- 花王（株）
- 協和発酵バイオ（株）
- クリムゾン インタラクティブ プライベート リミテッド
- 三洋電機（株）バイオメディカビジネスユニット
- シグマアルドリッチジャパン（株）
- （株）ジナリス
- 白井松器械（株）
- ストラタジーン・ジャパン（株）
- （独）製品評価技術基盤機構 バイオテクノロジー本部
- （株）セントラル科学貿易
- （株）耐熱性酵素研究所
- タカラバイオ（株）
- （株）ＤＮＡチップ研究所
- （株）トミー精工
- ニップンテクノクラスタ（株）
- 日本ジェネティクス（株）
- 日本バイオ・ラッド・ラボラトリーズ（株）
- ニュー・イングランド・バイオラボ・ジャパン（株）
- （財）野田産業科学研究所
- ノボザイムズ・ジャパン（株）
- （株）バイオマトリックス研究所
- 富士フイルム（株）
- プレジョン・システム・サイエンス（株）
- 北斗科学産業（株）
- （株）三菱総合研究所
- 明治乳業（株）
- （株）ヤクルト本社
- ロシュ・ダイアグノスティクス（株）
- 和研薬（株）
- 和光純薬工業（株）