下記の33団体に日本ゲノム微生物学会賛助会員としてご協力頂いております． （2010年2月8日現在 五十音順に掲載）
- 味の素（株）
- アジレント・テクノロジー（株）
- アフィメトリクス・ジャパン（株）
- （株）飯田フーズ
- イルミナ（株）
- インシリコバイオロジー（株）
- エムエス機器（株）
- 花王（株）
- 協和発酵バイオ（株）
- クリムゾン インタラクティブ プライベート リミテッド
- シグマアルドリッチジャパン（株）
- （株）ジナリス
- 白井松器械（株）
- （株）セントラル科学貿易
- （株）耐熱性酵素研究所
- タカラバイオ（株）
- （株）ＤＮＡチップ研究所
- ニップンテクノクラスタ（株）
- （株）ニッポンジーン
- 日本ジェネティクス（株）
- ニュー・イングランド・バイオラボ・ジャパン（株）
- （株）ネットウエル
- ノボザイムズ・ジャパン（株）
- （株）バイオメディカルサイエンス
- 富士フイルム（株）
- プレジョン・システム・サイエンス（株）
- （株）三菱総合研究所
- 明治乳業（株）
- （株）ヤクルト本社
- ライフテクノロジーズジャパン（株）
- ロシュ・ダイアグノスティクス（株）
- 和研薬（株）
- 和光純薬工業（株）